Code: https://github.com/JunMa11/AbdomenCT-1K
Pdf: https://arxiv.org/abs/2010.14808
值得重新考虑的是，腹腔器官分割是一个解决的问题吗？
存在以下限制：
- 缺乏大规模和多样化的数据集
- 缺乏对SOTA方法的综合评估
- 缺乏针对新出现的注释有效分割任务的基准
- 对基于器官边界的评估指标缺乏关注
ABDOMENCT-1K DATASET
基于现有的单中心数据集提出了一个大型腹部CT数据集，包括来自11个具有多中心、多阶段、多供应商的医疗中心的1064个CT病例和多种疾病病例。
数据集包含四个器官：肝脏、肾脏、脾和胰腺
评价指标
基于区域
Dice similarity coeffificient (DSC)： \[ DSC(G,S)=\frac{2|G\cap S|}{|G|+|S|} \]
基于边缘
Normalized surface Dice (NSD)： \[ N S D(G, S)=\frac{\left|\partial G \cap B_{\partial S}^{(\tau)}\right|+\left|\partial S \cap B_{\partial G}^{(\tau)}\right|}{|\partial G|+|\partial S|} \]
分类讨论“Is abdominal organ segmentation a solved problem?”
the answer would be Yes for liver, kidney and spleen segmentation, if
- 评估指标为DSC，主要用于评估基于区域的分割误差
- 测试集的数据分布与训练集相同。
- 测试集中的病例是微不足道的，这意味着这些病例没有严重的疾病且图像质量较低。
still remains to be an unsolved problem in following situations
- 评估指标为NSD，其重点是评估器官边界的准确性。
- 测试集来自新的医疗中心，其数据分布与培训集不同。
- 测试集中的病例有看不见或严重的不适，图像质量低下，例如异质性病变和噪音，而训练集中的病例则没有或只有很少的类似病例。